表达

矩阵

ExpressionMatrix

TCGA数据库

前情回顾

上回书说到，GEO数据库的表达矩阵制作。

GEO表达矩阵制作的主要步骤包括：

1、GSE数据集的下载

2、GPL平台注释文件的下载

3、ID2symbol转换探针的制作及转换

4、数据预处理：标准化、缺失值、重复值等

5、csv文件导出

TCGA表达矩阵的制作步骤基本相同，除了某些步骤存在细微的差异。

Nocheinmal.Losgehts!

TCGA数据下载

关于TCGA的数据下载，这里介绍一种使用UCSCXena网站的途径。

网址：